Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms