Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sgms2Q9D4B1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sgms2Q9D4B1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sgms2Q9D4B1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sgms2Q9D4B1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sgms2Q9D4B1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sgms2Q9D4B1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sgms2Q9D4B1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sgms2Q9D4B1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms2Q9D4B1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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