Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem53Q9D0Z3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms