Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nde1Q9CZA6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nde1Q9CZA6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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