Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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