Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gins3Q9CY94 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms