Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mis12Q9CY25 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mis12Q9CY25 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms