Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pard3bQ9CSB4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pard3bQ9CSB4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms