Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg12Q9CQY1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg12Q9CQY1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms