Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Smim8Q9CQQ0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms