Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nudt21Q9CQF3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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