Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nipsnap3bQ9CQE1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms