Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
1700029P11RikQ9CQ68 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms