Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rnaseh2cQ9CQ18 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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