Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsnaxip1Q99P25 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms