Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf3b1Q99NB9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3b1Q99NB9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms