Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Brms1Q99N20 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms