Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nus1Q99LJ8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms