Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clcc1Q99LI2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms