Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf19Q99KP6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prpf19Q99KP6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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