Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec3Q99J72 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms