Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim59Q922Y2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms