Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msi2Q920Q6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msi2Q920Q6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms