Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Odf3Q920N1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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