Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Grin3bQ91ZU9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms