Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pde6cQ91ZQ1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Pde6cQ91ZQ1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Pde6cQ91ZQ1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pde6cQ91ZQ1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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