Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lims2Q91XD2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms