Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep57l1Q8VDS7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cep57l1Q8VDS7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms