Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc6a20aQ8VDB9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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