Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brd8Q8R3B7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms