Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClmpQ8R373 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms