Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdc16Q8R349 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdc16Q8R349 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdc16Q8R349 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdc16Q8R349 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdc16Q8R349 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms