Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CipcQ8R0W1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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