Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hecw1Q8K4P8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms