Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Casc3Q8K3W3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms