Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rasgef1bQ8JZL7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rasgef1bQ8JZL7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rasgef1bQ8JZL7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rasgef1bQ8JZL7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms