Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LgsnQ8CIX8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms