Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TwnkQ8CIW5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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TwnkQ8CIW5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TwnkQ8CIW5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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