Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps50Q8CI71 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps50Q8CI71 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps50Q8CI71 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps50Q8CI71 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps50Q8CI71 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps50Q8CI71 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vps50Q8CI71 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vps50Q8CI71 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps50Q8CI71 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms