Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cdkl1Q8CEQ0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms