Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ephb1Q8CBF3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms