Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc159Q8C963 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms