Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms