Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfrp1Q8C4U3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms