Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms