Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp47Q8BY87 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp47Q8BY87 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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