Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Iffo1Q8BXL9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Iffo1Q8BXL9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Iffo1Q8BXL9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Iffo1Q8BXL9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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