Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trerf1Q8BXJ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trerf1Q8BXJ2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms