Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmod1Q8BVA4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms