Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp398Q8BV16 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp398Q8BV16 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms